近日,一組意大利學(xué)者撰文,闡述研究顯示,新型冠狀病毒有可能在2019年10月至11月就已經(jīng)開始傳播。這篇意大利米蘭國立大學(xué)的論文于2020年2月25日在線發(fā)表于《醫(yī)學(xué)病毒學(xué)雜志》(Journal of Medical Virology),題目為《SARS‐CoV‐2有效繁殖數(shù)量的早期系統(tǒng)發(fā)育評估》(Early phylogenetic estimate of the effective reproduction number of SARS‐CoV‐2)。
《醫(yī)學(xué)病毒學(xué)雜志》4月號封面(來源:Wiley Online Library)
以下是綠會國際部同事整理為中文的該論文摘要,(限于水平,可能存在與原文不盡吻合之處),供讀者參考。
【摘要】
為了重建最近在中國武漢爆發(fā)的新型冠狀病毒的進(jìn)化動態(tài),全球共享所有流感數(shù)據(jù)倡議組織于2020年2月4日提供的52個SARS‐CoV‐2基因組被進(jìn)行了分析。用于估計(jì)繁殖數(shù)量的兩個模型(基于合并的指數(shù)增長和出生-死亡天際線法)表明,估計(jì)的平均進(jìn)化率為7.8×10−4個子/位點(diǎn)/年(范圍1.1×10−4‐15×10−4)和樹根的平均tMRCA為73天。估計(jì)的R值為2.6 (范圍為2.1‐5.1),并且在2019年12月從0.8上升至2.4。該流行病的估計(jì)平均倍增時間在3.6天到4.1天之間。這項(xiàng)研究證明了即使在流行病流行的情況下,系統(tǒng)發(fā)育學(xué)也有助于監(jiān)測新出現(xiàn)的新感染。
(來源:Wiley Online Library)
該論文強(qiáng)調(diào):
本研究的目的是研究SARS‐CoV‐2的時間起源、病毒進(jìn)化速率和種群動態(tài)。
所使用的貝葉斯方法指出了2019年10月至11月間該流行病最可能的起源。
到2019年12月,當(dāng)平均翻倍時間為4天左右時,預(yù)計(jì)有效繁殖數(shù)從0.8增加到2.4。
本研究證明了系統(tǒng)發(fā)育在監(jiān)測新發(fā)感染中的作用。
同時,圍繞該論文得出的結(jié)論,綠會還了解到以下信息:
模型結(jié)論:新型冠狀病毒早在2019年10-11月就已經(jīng)開始傳播。
本研究中獲得的SARS-CoV-2系統(tǒng)發(fā)育的時間重建與先前的估計(jì)相符,表明該流行病起源于2019年10月至2019年11月之間,即描述第一例病例(武漢能查證到的12月1日最早病例)數(shù)周之前。這通過合并分析和估計(jì)流行病起源的出生死亡方法得到了證實(shí)。
(來源:Wiley Online Library)
意大利學(xué)者認(rèn)為新型冠狀病毒在去年12月中旬就已經(jīng)在意大利爆發(fā),之前檢出的38歲的意大利科多尼奧男子并非該國第一個病患,否則解釋不了意大利在短時間內(nèi)突然檢查出來幾百例被傳染者。
另據(jù)報(bào)道,去年圣誕節(jié)期間意大利皮亞琴察市醫(yī)院已經(jīng)住滿了40多例異常肺炎患者。
【參考鏈接:】
《醫(yī)學(xué)病毒學(xué)雜志》在線論文原文《SARS‐CoV‐2有效繁殖數(shù)量的早期系統(tǒng)發(fā)育評估》
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/jmv.25723
《SARS‐CoV‐2有效繁殖數(shù)量的早期系統(tǒng)發(fā)育評估》PDF版本:
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1002/jmv.25723
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